Hormis son travail d'artiste visuel orienté vers le champ de la photographie, Joan Fontcuberta développe une activité plurielle comme enseignant, critique, commissaire d'exposition et historien.
Professeur invité dans différents centres et universités en Europe et aux Etats-Unis (Universitat Pompeu Fabra à Barcelone, Harvard University de Cambridge aux Etats-Unis, University of Wales au Royaume-Uni, Le Fresnoy en France), il collabore régulièrement à des publications consacrées à l'art et à l'image. En 1980, il est co-fondateur de la revue bilingue (Espagnol/Anglais) Photovision, il en dirige la rédaction jusqu’à 2004.
Promoteur et fondateur de nombreuses manifestations photographiques, il co-fonde en 1982 la Primavera Fotográfica de Barcelone. En 1996, Joan Fontcuberta est nommé directeur artistique des Rencontres Internationales de la Photographie d'Arles.
En 2008 il a été nommé president de l’Association d’Artistes Visuels de la Catalogne.
« De Facto », une rétrospective de son travail de création vient d’être presenté par La Virreina, Centre de la Imatge, à Barcelone, avec la publication de la monographie « Le livre des merveilles ».